後藤健二（ごとう けんじ）は、日本の財務・金融官僚。 東京大学法学部卒業。1988年4月 大蔵省入省。大臣官房調査企画課。1990年 留学（ケルン大学）。1992年7月 国際金融局総務課調整係長。1994年7月 左京税務署長。2006年7月28日 金融庁監督局総務課コングロマリット室長兼監督局総務課金融安定調整官兼監督局総務課国際監督調整官。2013年6月28日 金融庁証券取引等監視委員会事務局特別調査課長。2014年7月9日 内閣府政策統括官（経済社会システム担当）付参事官（財政運営基本方針担当）。2016年6月22日 財務省大臣官房政策金融課長。2017年7月7日 仙台国税局長。2018年7月27日 国税庁調査査察部長。
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