村上 芳太郎（むらかみ よしたろう、1861年4月13日（文久元年3月4日）- 1909年（明治42年）1月15日）は、明治期の実業家、政治家。衆議院議員、愛媛県越智郡今治町長。 伊予国越智郡今治中浜町（愛媛県越智郡今治中浜町、今治町を経て現今治市中浜町）で、商家に生まれた。漢学、法律学、経済学を修めた。 中浜町会議員、今治町会議員を務めた。1886年（明治19年）3月、愛媛県会議員に選出され、1894年（明治27年）9月まで在任。高須峯造の勧めで立憲改進党に所属した。1891年（明治24年）4月、今治町長に就任し1893年（明治26年）2月まで務めた。その他、連合町村会議員、所得税調査委員、学務委員などにも在任した。
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