深谷 賢治（ふかや けんじ、1959年3月12日 - ）は、日本の数学者。専門は幾何学で、リーマン多様体の崩壊、アーノルド予想の解決、ミラー対称性予想への貢献、深谷圏（英語版）(A∞圏)の定義等の業績がある。学位は博士（1986年）。ニューヨーク州立大学ストーニーブルック校教授。2009年より日本学士院会員。 愛知県名古屋市生まれ、神奈川県横浜市育ち。横浜市立斎藤分小学校、横浜市立六角橋中学校、神奈川県立横浜翠嵐高等学校を経て、1981年東京大学理学部数学科卒業。1983年東京大学大学院理学系研究科修士課程修了。同年より東京大学助手となり、1986年東京大学から理学博士の学位を取得。1987年東京大学助教授、1994年より京都大学理学部数学科教授。
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