藤井 厚二（ふじい こうじ、1888年〈明治21年〉12月8日 - 1938年〈昭和13年〉7月17日）は、日本の建築家・建築学者。広島県出身。建築環境工学の先駆者の一人。東京帝国大学工科大学建築学科卒業。 広島県福山市の酒造家・金融業の「くろがねや」の次男として生まれる。経済的にも文化的にも恵まれた環境で育ち、福山中学校（現・福山誠之館高校）、第六高等学校を経て、1913年（大正2年）に東京帝国大学工科大学建築学科を卒業した後、竹中工務店に就職。大阪朝日新聞社などの設計を手がけ、1919年（大正8年）まで勤務。同社退職後から約9ヶ月間、欧米諸国を巡遊し、環境工学への関心を高めた。 欧米から帰国した後の1920年（大正9年）、同郷の武田五一が創設した京都帝国大学工学部建築学科に招かれ、1926年（大正15年）に教授となった。
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